Kongen vil også offisielt bli ønsket velkommen av landets statsminister, Anthony Albanese.
Det var et besøk som gjenopptok spørsmålet om Australia skulle bli en republikk – med den såkalte En «snob» i resepsjonen fremhevet av Daily Mirror, utvendig.
Bev McArthur, en pro-monarkistisk aktivist og liberal parlamentsmedlem, sa til ABC News radio at det var en «fornærmelse» at statsministere ikke skulle til neste mandags mottakelse.
«Det faktum at statsministere ikke deltok på mottakelsen i Canberra er helt uforsvarlig,» sa hun til BBC, og anklaget dem for «gestepolitikk».
«Å ønske kongen og dronningen velkommen til Australia er det minste de kan gjøre som de høyeste folkevalgte representantene for staten deres,» sa hun.
Hun skrev på sosiale medier og sa at kongen ble «snubbet».
Ms McArthur var ikke overbevist av unnskyldningene fra regionale regjeringsledere – som inkluderte andre engasjementer og møter den dagen – og sa til BBC at det var «smålig og ugjestmildt».
Victorias statsminister Jacinta Allan kan ikke gå fordi hun er opptatt med annen statlig virksomhet, men på en nylig pressekonferanse sa hun at hun var «veldig fornøyd med at kong Charles besøker Australia.
På spørsmål om hennes syn på at Australia skal bli en republikk, sa hun at det var «noe jeg ville støttet, men det er ikke noe som er en toppprioritet for meg for øyeblikket».
Visestatsministeren vil heller ikke delta, så staten vil være representert av guvernøren i Victoria, professor Margaret Gardner.
Ms McArthur, som talte på vegne av Australian Monarchist League, sa at det konstitusjonelle monarkiet ga et «veldig stabilt styresystem», og at en valgt president ville bety et annet regjeringsnivå.
Hun sa at den siste meningsmålingen i Australia viste at flere fortsatt ønsket et konstitusjonelt monarki i stedet for en republikk.
Men den australske republikkens bevegelse krever en slutt på kongens rolle som Australias statsoverhode – og har kalt det kongelige besøket for monarkiets «avskjedsturné».
«Det er på tide for Australia å velge et lokalt statsoverhode. Noen som kan jobbe for Australia på heltid,» sa talsmann Isaac Jeffrey.
I en brevveksling med Australian Republic Movement bekreftet kongen at hvorvidt Australia skulle bli en republikk var «en sak som skulle avgjøres av den australske offentligheten».
Besøket til Australia blir kongens største reise siden kreftdiagnosen hans tidligere i år.
Behandlingen hans bør avbrytes under reisen.
Etter den australske etappen av reisen vil kongen og dronningen reise til Samoa for regjeringssjefsmøtet i Commonwealth.
«Reiseelsker. Twitter-forsker. Forfatter. Ekstrem kaffeguru. Ond popkulturfanatiker.»